传统的蛋白质表达纯化流程极其依赖人工操作，并且往往需要几周或者几个月的时间。无细胞蛋白表达的兴起可将这一时间缩短至十几个小时，但是仍需要现进行表达载体的制备，体外扩增和高通量蛋白表达然后再进行筛选等多步操作。Nuclera将这些复杂的流程集合到eProtein Discovery系统。该系统使用基于数字微流控的智能卡盒、蛋白质质量检测和无细胞蛋白质合成，使研究人员更容易大规模获取高质量蛋白质。
只要将目标蛋白质的序列输入配套软件，就可以利用预设融合标签定制DNA构建体以优化表达，然后将表达载体装载到机器上，该系统就会通过自动化构建筛选（可同时筛24种构建体x8种无细胞表达条件= 192种表达条件），在48小时内，根据可溶性、可纯化性和纯化产量数据确定最佳表达条件，然后扩大.规模并获取蛋白质以供下游应用。该工作流程仅需3步，可生产18kDa~300kDa的蛋白质，还更容易地筛选和获取同源物、直系同源物、突变和异构体。
1. 设计与准备：将蛋白质序列输入软件，利用预设融合标签定制构建体设计，并使用eGene Prep试剂盒制备表达构建体。
2. 表达与纯化：自动化筛选192种表达条件以评估可溶性产量，再从其中选取30种进行strep-tag可纯化性评估，依据筛选数据确定最.优eGene /无细胞混合组合，整个过程快速效率高，为后续研究奠定基础。
3. 放大与应用：基于筛选结果对蛋白质进行微克至毫克级别的放大生产，最终获得高纯度蛋白质，满足不同实验需求。
